El CCP cuenta con más de 1000 volúmenes en su Biblioteca General Yucatanense, que se encuentra especializada en el área maya y la cultura peninsular. Actualmente en proceso de integración.
Además posee colecciones bibliográficas particulares repartidas en los fondos de Jorge Ignacio Rubio Mañé que cuenta con 1,000 ejemplares; José Díaz Bolio con 500 volúmenes; Nidia Esther Rosado Bacelis con 850 libros y la colección Antonia Jiménez Trava con 200 ejemplares.
